RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 VAV3Q9UKW4 847 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP20Q9Y2K6 914 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 DIAPH2O60879 1101 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SLC34A2O95436 690 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RSPH10BP0C881 870 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 STRN3Q13033 797 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 KRT35Q92764 455 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 LENG9Q96B70 501 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CCDC17Q96LX7 622 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 KCND2Q9NZV8 630 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ZNF536O15090 1300 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L15C9J2P7 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L11C9JVI0 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L18D6R9N7 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L22D6RA61 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L19D6RCP7 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L20D6RJB6 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 MEIS2O14770 477 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 UNC5CO95185 931 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CYP3A4P08684 503 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 COMTP21964 271 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SLCO1A2P46721 670 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L24Q0WX57 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 BFSP1Q12934 665 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 MTFR1Q15390 333 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CCDC38Q502W7 563 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 PRR16Q569H4 304 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 FAM212AQ96EL1 285 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 TMEM237Q96Q45 408 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 MEIS1O00470 390 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 FSCN2O14926 492 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 PMM2O15305 246 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SORBS3O60504 671 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 TTC4O95801 387 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CYP1A2P05177 515 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RWDD2BP57060 319 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CETN1Q12798 172 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 PTK6Q13882 451 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CBWD6Q4V339 395 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 RELL1Q8IUW5 271 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 BBOF1Q8ND07 529 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 LMO3Q8TAP4 145 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 INPP5DQ92835 1189 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SNF8Q96H20 258 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 PARVGQ9HBI0 331 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 AAASQ9NRG9 546 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 A6NHS1 94 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-202ENST00000542324 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms