RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF202O95125 648 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 F2P00734 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 FLT3P36888 993 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 BCAR1P56945 870 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 DSG1Q02413 1049 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 HHEXQ03014 270 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY1Q08828 1119 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ABHD18Q0P651 414 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 GAGE13Q4V321 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 D2HGDHQ8N465 521 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ZMAT4Q9H898 229 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MBD5Q9P267 1494 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TCEA2Q15560 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 DYDC2Q96IM9 177 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SOX7Q9BT81 388 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 DIP2AQ14689 1571 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 BPIFB4P59827 614 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 C1QTNF8P60827 252 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TCIRG1Q13488 830 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 IDI1Q13907 227 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TKFCQ3LXA3 575 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 AMER2Q8N7J2 671 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 WDR92Q96MX6 357 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ATRNO75882 1429 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TET3O43151 1660 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PRX2 142 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MCM7P33993 719 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC32Q14392 662 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 NINJ1Q92982 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MYL10Q9BUA6 226 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TGM5O43548 720 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY2Q08462 1091 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 GAREM2Q75VX8 874 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 HOMER1Q86YM7 354 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 NXPE1Q8N323 547 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 EFHBQ8N7U6 833 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MIEF2Q96C03 454 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MTG2Q9H4K7 406 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TBX22Q9Y458 520 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2QL1A1L167 161 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 CAPN14A8MX76 684 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 CYP27B1O15528 508 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 MTSS1O43312 755 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 OPHN1O60890 802 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 TOX4O94842 621 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.353e-7■■■□□ 16.8
PDE4D-217ENST00000509355 SCNN1GP51170 649 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 HTR3DQ70Z44 454 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 POFUT1Q9H488 388 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 IL23AQ9NPF7 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-217ENST00000509355 DNAI1Q9UI46 699 aa6.64□□□□□ -1.35
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