RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADCY6	O43306	1168 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	MSC	O60682	206 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	TOM1L1	O75674	476 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRKCB	P05771	671 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC9A1	P19634	815 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	MXI1	P50539	228 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PTEN	P60484	403 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	GRM1	Q13255	1194 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PSMD6	Q15008	389 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	GRIK4	Q16099	956 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	CHP1	Q99653	195 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	FZD8	Q9H461	694 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113	EVPL	Q92817	2033 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TMBIM1-223	ENST00000495113		A0A0B4J269	797 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	HAS3	O00219	553 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ACKR2	O00590	384 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZEB2	O60315	1214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SERPING1	P05155	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CYBA	P13498	195 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CTGF	P29279	349 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLCN3	P51790	818 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	IGBP1	P78318	339 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLDN10	P78369	228 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SP3	Q02447	781 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	MTF1	Q14872	753 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SURF1	Q15526	300 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ASIC2	Q16515	512 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	KRT39	Q6A163	491 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLDN3	O15551	220 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	LCA5L	O95447	670 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	GNRH1	P01148	92 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	FER	P16591	822 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	HOXD10	P28358	340 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP2K2	P36507	400 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRKCI	P41743	596 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	FLT3LG	P49771	235 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	AP3M2	P53677	418 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	TERF1	P54274	439 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	JAM2	P57087	298 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	DLG4	P78352	724 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	NKX3-2	P78367	333 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TMBIM1-223	ENST00000495113	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3

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