RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 METTL13Q8N6R0 699 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CNNM3Q8NE01 707 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 PAGE5Q96GU1 130 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TIPINQ9BVW5 301 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SPTBN2O15020 2390 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SELPP16109 830 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TMOD1P28289 359 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DNM2P50570 870 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GIT2Q14161 759 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ACAP1Q15027 740 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 IER5Q5VY09 327 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KANK3Q6NY19 840 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NME8Q8N427 588 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GPT2Q8TD30 523 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TCP11Q8WWU5 503 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 STAMQ92783 540 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM143Q96AN5 459 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DACT1Q9NYF0 836 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NOD1Q9Y239 953 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA1671Q9BY89 1806 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SPEGQ15772 3267 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KINO60870 393 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 HIP1RO75146 1068 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MYL1P05976 194 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CKBP12277 381 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 PTMSP20962 102 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ARL2P36404 184 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 AFMP43652 599 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CLCN3P51790 818 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RBL2Q08999 1139 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DRP2Q13474 957 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX12PQ92771 950 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SAMD11Q96NU1 681 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 REEP2Q9BRK0 252 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM9Q9C026 710 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MYH11P35749 1972 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ASAP2O43150 1006 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CAND2O75155 1236 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MBD3O95983 291 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFV1P49821 464 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RBM10P98175 930 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CDC42EP1Q00587 391 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MAPK7Q13164 816 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CUL4BQ13620 913 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 IKBKEQ14164 716 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DYMQ7RTS9 669 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RSPH3Q86UC2 560 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DAW1Q8N136 415 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 CAGE1Q8TC20 777 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KIFAP3Q92845 792 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 DRC1Q96MC2 740 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 MAP7D2Q96T17 732 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 POLD4Q9HCU8 107 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 AKT3Q9Y243 479 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NCK2O43639 380 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GPR32O75388 356 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 VTNP04004 478 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR29P0C7W0 189 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 RSPH10BP0C881 870 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 GLRA2P23416 452 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms