RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 C5orf42Q9H799 3197 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 A0A1B0GUA9 196 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 PP2D1A8MPX8 630 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 INPPL1O15357 1258 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 SLC11A1P49279 550 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 ZP2Q05996 745 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 DEPTORQ8TB45 409 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 IFT74Q96LB3 600 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 FZD8Q9H461 694 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 DNM3Q9UQ16 869 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 HES2Q9Y543 173 aa25.21■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.2■■□□□ 1.63
MKL1-208ENST00000466278 B4GALT3O60512 393 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 NPTXRO95502 500 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 POMCP01189 267 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 MLH1P40692 756 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CUL4AQ13619 759 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 MAPK6Q16659 721 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 VPS52Q8N1B4 723 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 APOL6Q9BWW8 343 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 BACH2Q9BYV9 841 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ZBP1Q9H171 429 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 RNF39Q9H2S5 420 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 STK39Q9UEW8 545 aa25.2■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ARL5CA6NH57 179 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 DDHD2O94830 711 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CA8P35219 290 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 KCNC3Q14003 757 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 GAD1Q99259 594 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.19■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 E9PMD0 336 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 N4BP3O15049 544 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 PRKCBP05771 671 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CTSAP10619 480 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CDC25AP30304 524 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 BRAPQ7Z569 592 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.18■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ALDH2P05091 517 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 SCNN1GP51170 649 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 EFNA5P52803 228 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 GIT2Q14161 759 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ZFP42Q96MM3 310 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 IRAK3Q9Y616 596 aa25.17■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ACKR2O00590 384 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 NRP1O14786 923 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CXCL14O95715 111 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 PDCP20941 246 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 DSC1Q08554 894 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 HYIQ5T013 277 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CASP10Q92851 521 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.622e-7■■■■□ 22
MKL1-208ENST00000466278 ADPGKQ9BRR6 497 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 BMP15O95972 392 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 LIG1P18858 919 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 AKAP5P24588 427 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 KCNK18Q7Z418 384 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 DRC1Q96MC2 740 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.15■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 NR1I2O75469 434 aa25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 OR1G1P47890 313 aa25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 GRIK3Q13003 919 aa25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
MKL1-208ENST00000466278 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms