RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP28Q96RU2 1077 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LZTS1Q9Y250 596 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLCG1P19174 1290 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NPTX2P47972 431 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMTNP53814 917 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLCB3Q01970 1234 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TFF2Q03403 129 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM169Q96HH4 297 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HES2Q9Y543 173 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POMCP01189 267 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJB1P25685 340 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC39A14Q15043 492 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPECC1Q5M775 1068 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPBP1Q86WP2 473 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DAW1Q8N136 415 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGFLR1Q9H665 355 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PARP2Q9UGN5 583 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARL5CA6NH57 179 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SFI1A8K8P3 1242 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLS3P13797 630 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNA5P22460 613 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MLH1P40692 756 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STRN3Q13033 797 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAMK1Q14012 370 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD54LQ92698 747 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPSTI1Q96J88 318 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAD1Q99259 594 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF39Q9H2S5 420 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLDND1Q9NY35 253 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NR1I2O75469 434 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKAP5P24588 427 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IRS1P35568 1242 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPK7Q13164 816 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMC7Q7Z402 723 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLIC6Q96NY7 704 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCF25Q9BQ70 676 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLE6Q9H808 572 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FSD2A1L4K1 749 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H0YCG3 227 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC16A4O15374 487 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM13AO94988 1023 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 F13A1P00488 732 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH2P05091 517 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CA8P35219 290 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HYAL1Q12794 435 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCM6Q14566 821 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK17AQ9UEE5 414 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO7AQ13402 2215 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPTLC2O15270 562 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALTP07902 379 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDIT3P35638 169 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRIP1P48552 1158 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCNN1GP51170 649 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BECN1Q14457 450 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms