RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BSNDQ8WZ55 320 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM169Q96HH4 297 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DNM3Q9UQ16 869 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 IRAK3Q9Y616 596 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CXCL14O95715 111 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 POMCP01189 267 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CDC25AP30304 524 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PLA2G5P39877 138 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SLC11A1P49279 550 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PPP2R5AQ15172 486 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CLUL1Q15846 466 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HYIQ5T013 277 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 KIFAP3Q92845 792 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.076e-6■■■■□ 21
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 MIOSQ9NXC5 875 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 STK39Q9UEW8 545 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HES2Q9Y543 173 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ARL5CA6NH57 179 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PP2D1A8MPX8 630 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 E9PMD0 336 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ACKR2O00590 384 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NRP1O14786 923 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CTSAP10619 480 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DSC1Q08554 894 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 GIT2Q14161 759 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 MAPK6Q16659 721 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HACE1Q8IYU2 909 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 VPS52Q8N1B4 723 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 GAD1Q99259 594 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZBP1Q9H171 429 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 EFEMP2O95967 443 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 EFNA5P52803 228 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DEPTORQ8TB45 409 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SUSD6Q92537 303 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 IFT74Q96LB3 600 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 GBP3Q9H0R5 595 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 S1PR5Q9H228 398 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 POLD4Q9HCU8 107 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 LILRB3O75022 631 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NPTXRO95502 500 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 AKAP5P24588 427 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 MLH1P40692 756 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 KCNK18Q7Z418 384 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 BRAPQ7Z569 592 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DAW1Q8N136 415 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP42Q96MM3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PNMA5Q96PV4 448 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf42Q9H799 3197 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 N4BP3O15049 544 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf3-210ENST00000462125 SLC26A4O43511 780 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf3-210ENST00000462125 EDN1P05305 212 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf3-210ENST00000462125 PRKCBP05771 671 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms