RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	LIG1	P18858	919 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	PRPH	P41219	470 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	DUSP6	Q16828	381 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	IPP	Q9Y573	584 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PARL-208	ENST00000450375	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	B4GALT5	O43286	388 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	NR1I2	O75469	434 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	NPTXR	O95502	500 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CXCL14	O95715	111 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	POMC	P01189	267 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ALDH2	P05091	517 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	GALT	P07902	379 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	TIE1	P35590	1138 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	NAMPT	P43490	491 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SLC11A1	P49279	550 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	COASY	Q13057	564 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	MAPK6	Q16659	721 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	AMHR2	Q16671	573 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	GAD1	Q99259	594 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	HES2	Q9Y543	173 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CIT	O14578	2027 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375		A0A1B0GUA9	196 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	N4BP3	O15049	544 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	EYA4	O95677	639 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	GLP2R	O95838	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	PRKCB	P05771	671 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CDC25A	P30304	524 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	MLH1	P40692	756 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	EFNA5	P52803	228 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ZP2	Q05996	745 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	GIT2	Q14161	759 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ECM1	Q16610	540 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	TRIO	O75962	3097 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375		E9PMD0	336 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	DDHD2	O94830	711 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	BMP15	O95972	392 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	CTSA	P10619	480 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	PDC	P20941	246 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	AKAP5	P24588	427 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	OR1G1	P47890	313 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	SCNN1G	P51170	649 aa		10	□□□□□ -0.81
PARL-208	ENST00000450375	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms