RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 ACEP12821 1306 aa7.31□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 SDHAP31040 664 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 HIPK4Q8NE63 616 aa7.31□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.29□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.29□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.28□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.27□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 BCL9O00512 1426 aa7.27□□□□□ -1.24
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C9orf3-205ENST00000427193 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 AMER2Q8N7J2 671 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 IL17DQ8TAD2 202 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 MKL1Q969V6 931 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 INSRP06213 1382 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-205ENST00000427193 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.26□□□□□ -1.25
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