RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	VPS52	Q8N1B4	723 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	FZD8	Q9H461	694 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PP2D1	A8MPX8	630 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	INPPL1	O15357	1258 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ZBP1	Q9H171	429 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ARL5C	A6NH57	179 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CXCL14	O95715	111 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM187B	Q17R55	369 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	KRT79	Q5XKE5	535 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	GAD1	Q99259	594 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	POLD4	Q9HCU8	107 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	NPTXR	O95502	500 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ALDH2	P05091	517 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CDC25A	P30304	524 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	NAMPT	P43490	491 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	APOL6	Q9BWW8	343 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	MLH1	P40692	756 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	HACE1	Q8IYU2	909 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ZFP42	Q96MM3	310 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	MIOS	Q9NXC5	875 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	DNM3	Q9UQ16	869 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484		E9PMD0	336 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	NRP1	O14786	923 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CTSA	P10619	480 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CA8	P35219	290 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP2R5A	Q15172	486 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	IRAK3	Q9Y616	596 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	AKAP5	P24588	427 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	MAPK6	Q16659	721 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	KIFAP3	Q92845	792 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	SCNN1G	P51170	649 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	IFT74	Q96LB3	600 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	S1PR5	Q9H228	398 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	PRKCB	P05771	671 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	DSC1	Q08554	894 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	CUL4A	Q13619	759 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	GIT2	Q14161	759 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	STK39	Q9UEW8	545 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	ACKR2	O00590	384 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	N4BP3	O15049	544 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	EDN1	P05305	212 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNK18	Q7Z418	384 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	SUSD6	Q92537	303 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	CASP10	Q92851	521 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	BACH2	Q9BYV9	841 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	USP20	Q9Y2K6	914 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	LIG1	P18858	919 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	OR1G1	P47890	313 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	EFNA5	P52803	228 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	MARCH5	Q9NX47	278 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	KLK14	Q9P0G3	267 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	PARP2	Q9UGN5	583 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CIZ1-209	ENST00000420484	ALAD	P13716	330 aa		32.77	■■■□□ 2.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms