RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342784.6

SYDE1-201, Transcript of synapse defective Rho GTPase homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SYDE1, Length 3,264 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1-201ENST00000342784 RAD21O60216 631 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 KCNH2Q12809 1159 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 VSTM1Q6UX27 236 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SERPINB12Q96P63 405 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 STK17AQ9UEE5 414 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PFASO15067 1338 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CAPN9O14815 690 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 GFPT2O94808 682 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CHRNA3P32297 505 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PSMC4P43686 418 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 GALCP54803 685 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CLUL1Q15846 466 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.66□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 TIPINQ9BVW5 301 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.66□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 BCL9O00512 1426 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 KRT38O76015 456 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NAT2P11245 290 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 UCHL3P15374 230 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 FAM136AQ96C01 138 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 HIC2Q96JB3 615 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CEP63Q96MT8 703 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PHF2O75151 1096 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 FAM200BP0CF97 657 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DNAJC3Q13217 504 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TNIP1Q15025 636 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DYDC2Q96IM9 177 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 CTSWP56202 376 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 VPS52Q8N1B4 723 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 RAB34Q9BZG1 259 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.65□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYDE1-201ENST00000342784 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 ITPK1Q13572 414 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 KRT79Q5XKE5 535 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 SLF2Q8IX21 1173 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.64□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.64□□□□□ -0.07
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