RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SERPINB12Q96P63 405 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FIZ1Q96SL8 496 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NOD2Q9HC29 1040 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 WHRNQ9P202 907 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 G3V3G9 751 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MAPK13O15264 365 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 LRRN2O75325 713 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SUN1O94901 812 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 COMTP21964 271 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MESDQ14696 234 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 COG2Q14746 738 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FAM228AQ86W67 206 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 LMO3Q8TAP4 145 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLCO2A1Q92959 643 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MRIQ9BWK5 157 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 O00370 1275 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PMM2O15305 246 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SPOPO43791 374 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NDUFB10O96000 172 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RWDD2BP57060 319 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CAV1Q03135 178 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TTC27Q6P3X3 843 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KRT35Q92764 455 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IFT74Q96LB3 600 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 DNAJC18Q9H819 358 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 USP20Q9Y2K6 914 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EMSYQ7Z589 1322 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SNX3O60493 162 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FGFR4P22455 802 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CRKP46108 304 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 VAMP7P51809 220 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PALB2Q86YC2 1186 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CD101Q93033 1021 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 HOOK2Q96ED9 719 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 STRA6Q9BX79 667 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 LRRC19Q9H756 370 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CHMP2AO43633 222 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ITIH2P19823 946 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NFIAQ12857 509 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EPC2Q52LR7 807 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ACCSQ96QU6 501 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IDI2Q9BXS1 227 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CLGNO14967 610 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CYP1A2P05177 515 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 POLR2MP0CAP2 368 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GYS1P13807 737 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MFAP3P55082 362 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SNAP25P60880 206 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 K7ENM7 598 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 OPLAHO14841 1288 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PYGMP11217 842 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IFNAR2P48551 515 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MARCKSL1P49006 195 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CRYMQ14894 314 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 AADACL2Q6P093 401 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms