RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.93■■□□□ 1.74
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SH3GL1-201ENST00000269886 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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SH3GL1-201ENST00000269886 TTC27Q6P3X3 843 aa25.91■■□□□ 1.74
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SH3GL1-201ENST00000269886 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.9■■□□□ 1.74
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SH3GL1-201ENST00000269886 QPCTQ16769 361 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 RAPGEF5Q92565 580 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 CCDC169A6NNP5 214 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3GL1-201ENST00000269886 LYPLA2O95372 231 aa25.88■■□□□ 1.73
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