RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RASGRF2O14827 1237 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NDUFB10O96000 172 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BCRP11274 1271 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GYS1P13807 737 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SLC8A1P32418 973 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MESDQ14696 234 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SLMAPQ14BN4 828 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CYP1B1Q16678 543 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ODR4Q5SWX8 454 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CCDC63Q8NA47 563 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NOD2Q9HC29 1040 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PPP2R5CQ13362 524 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DOK7Q18PE1 504 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CCDC38Q502W7 563 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SP8Q8IXZ3 490 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CD101Q93033 1021 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GMCL1Q96IK5 515 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EMSYQ7Z589 1322 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PIK3CDO00329 1044 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 KCNJ1P48048 391 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MFSD5Q6N075 450 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 STRA6Q9BX79 667 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.05■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SNX3O60493 162 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RTN2O75298 545 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GDF11O95390 407 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RARAP10276 462 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CRKP46108 304 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PRELPP51888 382 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PPP3CAQ08209 521 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SLC5A5Q92911 643 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MTA2O94776 668 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 APBA3O96018 575 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CHRNB2P17787 502 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TCP11Q8WWU5 503 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 KAT5Q92993 513 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BTBD6Q96KE9 485 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NACC1Q96RE7 527 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.04■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MYH11P35749 1972 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SGPL1O95470 568 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BMP3P12645 472 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CCDC25Q86WR0 208 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 VEZTQ9HBM0 779 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PASKQ96RG2 1323 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CFAP73A6NFT4 308 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TISP43B9A030 160 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ADRA2BP18089 450 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PDE6CP51160 858 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms