RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 DMAC2Q9NW81 257 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 GJB6O95452 261 aa22.95■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
TRIM28-201ENST00000253024 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 EGFRP00533 1210 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 GMNCA6NCL1 334 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CABS1Q96KC9 395 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 TRPC6Q9Y210 931 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SLX4Q8IY92 1834 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PTENP60484 403 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SEZ6Q53EL9 994 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 O00370 1275 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PEX10O60683 326 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ENTPD3O75355 529 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 VCAM1P19320 739 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PMS2P54278 862 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CREB1P16220 341 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CHRNB2P17787 502 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF131P52739 623 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CETN1Q12798 172 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CD302Q8IX05 232 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SYT11Q9BT88 431 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 FAM107AO95990 144 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 GPC5P78333 572 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 TNIP1Q15025 636 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PPP1R7Q15435 360 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 LONRF1Q17RB8 773 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 TKFCQ3LXA3 575 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 DENND2CQ68D51 928 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 BICD1Q96G01 975 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PSMD1Q99460 953 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 TBK1Q9UHD2 729 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CHN1P15882 459 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ADSSP30520 456 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CAP2P40123 477 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 AKT1S1Q96B36 256 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 USTQ9Y2C2 406 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RAB17Q9H0T7 212 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CD248Q9HCU0 757 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 LTBP1Q14766 1721 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 DENND3A2RUS2 1198 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 MTM1Q13496 603 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ACCSQ96QU6 501 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RARAP10276 462 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 DUPD1Q68J44 220 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 BSNDQ8WZ55 320 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.91■■□□□ 1.26
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