RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MORC4Q8TE76 937 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CD101Q93033 1021 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FAM212AQ96EL1 285 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SERPINB12Q96P63 405 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MTA2O94776 668 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SHMT1P34896 483 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 VSTM1Q6UX27 236 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ASRGL1Q7L266 308 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.61□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PASKQ96RG2 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FAM86B1E9PN63 330 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 H0YIN7 160 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 DPEP1P16444 411 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MYL7Q01449 175 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC38Q502W7 563 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 LMO3Q8TAP4 145 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF570Q96NI8 536 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FIZ1Q96SL8 496 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 USP40Q9NVE5 1235 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM120BA0PK00 339 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 TP73O15350 636 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ATP2B4P23634 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ATP5DP30049 168 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CIITAP33076 1130 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SREBF1P36956 1147 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 GPC5P78333 572 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PICALMQ13492 652 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 COG2Q14746 738 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SLCO2A1Q92959 643 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CNKSR1Q969H4 720 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 KLHL29Q96CT2 875 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 IFT74Q96LB3 600 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SYT17Q9BSW7 474 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 AAASQ9NRG9 546 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MSH4O15457 936 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 NEBLO76041 1014 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 UFL1O94874 794 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FAM13AO94988 1023 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 KRT16P08779 473 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 TRIM49P0CI25 452 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 TRIM49CP0CI26 452 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 PYGMP11217 842 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 COMTP21964 271 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CCNG1P51959 295 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CYP4A11Q02928 519 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SPATA21Q7Z572 469 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC19Q9H756 370 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRC17-201ENST00000249377 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms