RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 F2P00734 622 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ACTN1P12814 892 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TMOD1P28289 359 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CPT1AP50416 773 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PTENP60484 403 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 DLG4P78352 724 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 HTRA3P83110 453 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MYL7Q01449 175 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CYP24A1Q07973 514 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CETN1Q12798 172 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PPFIA1Q13136 1202 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 GRIK4Q16099 956 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MAPK6Q16659 721 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 DESI2Q9BSY9 194 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.27■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0B4J269 797 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 AKR1A1P14550 325 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 GTF2H1P32780 548 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 APBA1Q02410 837 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PPP3CAQ08209 521 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 EHBP1Q8NDI1 1231 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 FZD8Q9H461 694 aa18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 EDN1P05305 212 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PRKCBP05771 671 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 FLT3LGP49771 235 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 LMO3Q8TAP4 145 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP4Q96MN2 994 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 GABRQQ9UN88 632 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 USP20Q9Y2K6 914 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SIP14410 1827 aa18.25■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ACKR2O00590 384 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TOM1L1O75674 476 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 GCLMP48507 274 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SP3Q02447 781 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 KIF22Q14807 665 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 KAT2BQ92831 832 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC42Q96M95 316 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 NRCAMQ92823 1304 aa18.24■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 HAS3O00219 553 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CLDN3O15551 220 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TBC1D8O95759 1140 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SERPING1P05155 500 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 GJB1P08034 283 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CYBAP13498 195 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 RFX1P22670 979 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PHKA2P46019 1235 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CLDN10P78369 228 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 KRT83P78385 493 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 PSMD6Q15008 389 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 FAM187BQ17R55 369 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 EPC2Q52LR7 807 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 HGSNATQ68CP4 663 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 KRT39Q6A163 491 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TRPV1Q8NER1 839 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TRIB2Q92519 343 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 SPAG5Q96R06 1193 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MXI1P50539 228 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 JAM2P57087 298 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 MFSD10Q14728 455 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.23■□□□□ 0.51
TVP23C-201ENST00000225576 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms