RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSAD1	Q9HA92	442 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPG21	Q9NZD8	308 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HCST	Q9UBK5	93 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL6A3	P12111	3177 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	STX6	O43752	255 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	OFD1	O75665	1012 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DRC1	Q96MC2	740 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGFLR1	Q9H665	355 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLD4	Q9HCU8	107 aa		18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDH23	Q9H251	3354 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC169	A6NNP5	214 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC26A4	O43511	780 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	18.31	■□□□□ 0.52	7e-6	■■■■■ 33.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFNA5	P52803	228 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HYI	Q5T013	277 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBXN11	Q5T124	520 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GBP3	Q9H0R5	595 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLR9	Q9NR96	1032 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	IPP	Q9Y573	584 aa		18.31	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GUA9	196 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7ERI5	159 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	B4GALT5	O43286	388 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKCB	P05771	671 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNA5	P22460	613 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCAR1	P56945	870 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLCB3	Q01970	1234 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	REST	Q13127	1097 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMHR2	Q16671	573 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM187B	Q17R55	369 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	BSND	Q8WZ55	320 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM169	Q96HH4	297 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PNMA5	Q96PV4	448 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOL6	Q9BWW8	343 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FZD8	Q9H461	694 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLDND1	Q9NY35	253 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTMR6	Q9Y217	621 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LZTS1	Q9Y250	596 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLIC4	Q9Y696	253 aa		18.3	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	N4BP3	O15049	544 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIP1R	O75146	1068 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPTXR	O95502	500 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G4B	P0C869	781 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJB1	P25685	340 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PBX3	P40426	434 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNQ1	P51787	676 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PEX3	P56589	373 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAMK1	Q14012	370 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNK18	Q7Z418	384 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLE6	Q9H808	572 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		18.29	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACKR2	O00590	384 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	POMC	P01189	267 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDH2	P05091	517 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRS1	P35568	1242 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		18.28	■□□□□ 0.52

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