RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ACTN1P12814 892 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 PLCG1P19174 1290 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 USP11P51784 963 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF365Q70YC5 407 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 GJB6O95452 261 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 SKIP12755 728 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 CHKBQ9Y259 395 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 UBE4AQ14139 1066 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 PROM2Q8N271 834 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 CYTH2Q99418 400 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 UFL1O94874 794 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 FOXN2P32314 431 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 NAPAP54920 295 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2IP78347 998 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 SLC18A3Q16572 532 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 CFAP157Q5JU67 520 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 VSTM1Q6UX27 236 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf8Q96DM3 657 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 MPP4Q96JB8 637 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 SPAG7O75391 227 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 WFS1O76024 890 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 NOL4O94818 638 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 SERPING1P05155 500 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 LYNP07948 512 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 TECP42680 631 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRT-211ENST00000618610 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRT-211ENST00000618610 KLRC3Q07444 240 aa8.78□□□□□ -1
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