RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	RARRES1	P49788	294 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	PTEN	P60484	403 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NOTUM	Q6P988	496 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ITGA4	P13612	1032 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	POU5F1B	Q06416	359 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	VPS52	Q8N1B4	723 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NACC1	Q96RE7	527 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269		A0A087WWV3	80 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	OR52Z1	P0C646	297 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	HACE1	Q8IYU2	909 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	CASP10	Q92851	521 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC51	Q96ER9	411 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ALDH2	P05091	517 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	GALT	P07902	379 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TTC38	Q5R3I4	469 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	IGSF21	Q96ID5	467 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	STK39	Q9UEW8	545 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF3A	Q9Y496	699 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ARID2	Q68CP9	1835 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ARL2	P36404	184 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	GIT2	Q14161	759 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	C8orf34	Q49A92	452 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CPB2	Q96IY4	423 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ST18	O60284	1047 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TSPAN1	O60635	241 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TRAPPC10	P48553	1259 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CAPS	Q13938	189 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	UBXN11	Q5T124	520 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	RNF135	Q8IUD6	432 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	PRR33	A8MZF0	331 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	POMC	P01189	267 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	GLRA2	P23416	452 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	APOL5	Q9BWW9	433 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CSRNP2	Q9H175	543 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	MED24	O75448	989 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC11A1	P49279	550 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	RABEP1	Q15276	862 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CES5A	Q6NT32	575 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	IPP	Q9Y573	584 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	C5orf42	Q9H799	3197 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	NR1I2	O75469	434 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	RPA1	P27694	616 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF2C	Q99661	725 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	APOL6	Q9BWW8	343 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBP1	Q9H171	429 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CTSA	P10619	480 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	RAB34	Q9BZG1	259 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		32.71	■■■□□ 2.83

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