RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	GDA	Q9Y2T3	454 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	SYCE3	A1L190	88 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	RPS6KA5	O75582	802 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	CTSH	P09668	335 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	AXL	P30530	894 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	RFC2	P35250	354 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	PRCP	P42785	496 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	STX1A	Q16623	288 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	ZPBP2	Q6X784	338 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PSMA7	O14818	248 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ERLIN2	O94905	339 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CAVIN2	O95810	425 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PIGR	P01833	764 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRKCB	P05771	671 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TYRO3	Q06418	890 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CHST12	Q9NRB3	414 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PDXK	O00764	312 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	EVI5	O60447	810 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RAG1	P15918	1043 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	HOXD13	P35453	343 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LPIN1	Q14693	890 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	AMHR2	Q16671	573 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CENPP	Q6IPU0	288 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GBP3	Q9H0R5	595 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CXCL10	P02778	98 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CYP2C18	P33260	490 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF445	P59923	1031 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	MFSD5	Q6N075	450 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FAM228A	Q86W67	206 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM199	Q8N511	208 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC51	Q96ER9	411 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRO3102	Q9H379	93 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PADI3	Q9ULW8	664 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GUA9	196 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	BICDL2	A1A5D9	508 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TSPAN1	O60635	241 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TOM1L1	O75674	476 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GHR	P10912	638 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CCNE1	P24864	410 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LIG4	P49917	911 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC63	Q05C16	580 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	KCNA1	Q09470	495 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PAK2	Q13177	524 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	MBTPS1	Q14703	1052 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	APBB2	Q92870	758 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	BICD1	Q96G01	975 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		18.42	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms