RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.29■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.29■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 MYH11P35749 1972 aa23.29■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 AMHR2Q16671 573 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 KCNK18Q7Z418 384 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 HACE1Q8IYU2 909 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 BSNDQ8WZ55 320 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 DRC1Q96MC2 740 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 POLD4Q9HCU8 107 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.28■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 FGF18O76093 207 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 ITGA4P13612 1032 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 LIG1P18858 919 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 PPM1AP35813 382 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 UBE3AQ05086 875 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 MAPK6Q16659 721 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 TIPINQ9BVW5 301 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 RSAD1Q9HA92 442 aa23.27■■□□□ 1.32
SNAP23-216ENST00000568331 CARNS1A5YM72 827 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 B4GALT5O43286 388 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 HIP1RO75146 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 OFD1O75665 1012 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PRKCBP05771 671 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 EFNA5P52803 228 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KRT17Q04695 432 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 FAM187BQ17R55 369 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ASB2Q96Q27 587 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 FZD8Q9H461 694 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SPG21Q9NZD8 308 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 IPPQ9Y573 584 aa23.26■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC169A6NNP5 214 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PLA2G4BP0C869 781 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 DNAJB1P25685 340 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 TFF2Q03403 129 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.25■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 A0A1B0GUA9 196 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 N4BP3O15049 544 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 NCK2O43639 380 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 NPTXRO95502 500 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 GUCY2CP25092 1073 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PEX3P56589 373 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 BCAR1P56945 870 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PLCB3Q01970 1234 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PTPAQ15257 358 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 APOL6Q9BWW8 343 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 GBP3Q9H0R5 595 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 TLR9Q9NR96 1032 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KCND2Q9NZV8 630 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 K7ERI5 159 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 DLL1O00548 723 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ACKR2O00590 384 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 PBX3P40426 434 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 GRIN1Q05586 938 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 CAMK1Q14012 370 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 LZTS1Q9Y250 596 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNAP23-216ENST00000568331 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms