RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOGQ13253 232 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACER1Q8TDN7 264 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOPCQ9HD26 462 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEL1LQ9UBV2 794 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTUQ9ULD6 942 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB39O15060 712 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAD51CO43502 376 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAS7O60861 476 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 H2AFZP0C0S5 128 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 MUTP22033 750 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUL1Q13616 776 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC174Q6PII3 467 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 H2AFVQ71UI9 128 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 FIZ1Q96SL8 496 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ISCUQ9H1K1 167 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PICK1Q9NRD5 415 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.113e-13■■■■■ 28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAEPP09466 180 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAT1P42224 750 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP1A2P50993 1020 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF131P52739 623 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GUCY1A3Q02108 690 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERO1BQ86YB8 467 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GFPT2O94808 682 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBXN2AP68543 259 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 BIRC3Q13489 604 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 COG2Q14746 738 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCFD2Q8WU76 684 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 P3H4Q92791 437 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 C5orf60A6NFR6 353 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 H0YGN5 161 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 H0YHG0 523 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO1FO00160 1098 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRF6O14896 467 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRAP18433 802 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 FMO5P49326 533 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP55Q53EZ4 464 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD16Q68DU8 428 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 NACC1Q96RE7 527 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCND2Q9NZV8 630 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFS1Q9Y697 457 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP104O60308 925 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 EVI5O60447 810 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOX5P35711 763 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KSR1Q8IVT5 923 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 F8VZ95 297 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC172P0C7W6 258 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPEPPSP55786 919 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 WLSQ5T9L3 541 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 METTL13Q8N6R0 699 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK33Q9BYT3 514 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 DMAC2Q9NW81 257 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 GUCY2FP51841 1108 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEX26Q7Z412 305 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC45Q96CN5 670 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLC4Q9NSK0 619 aa21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms