RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIOO75962 3097 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GLP2RO95838 553 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BMP15O95972 392 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PPM1AP35813 382 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC42EP1Q00587 391 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PLCB3Q01970 1234 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP6Q16828 381 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HYIQ5T013 277 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNK18Q7Z418 384 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF410Q86VK4 478 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ABI1Q8IZP0 508 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRP7Q8WX94 980 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXL18Q96ME1 805 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PNMA5Q96PV4 448 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 USP28Q96RU2 1077 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 MTRQ99707 1265 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FGFR4P22455 802 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ARL2P36404 184 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT17Q04695 432 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PRRX2Q99811 253 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CWH43Q9H720 699 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 STK24Q9Y6E0 443 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FSCN2O14926 492 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PER2O15055 1255 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FGFR1P11362 822 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ERVFC1P60507 584 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 NHLH1Q02575 133 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT79Q5XKE5 535 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC43Q8N309 656 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 TCP11Q8WWU5 503 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRP4Q96MN2 994 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PADI6Q6TGC4 694 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC15Q8TF66 581 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF558Q96NG5 402 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CARNS1A5YM72 827 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM221A6NGB7 291 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 E9PMD0 336 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 M0R296 226 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ASAP2O43150 1006 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 EOMESO95936 686 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP11B2P19099 503 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GLRA2P23416 452 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZXDAP98168 799 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SUSD6Q92537 303 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 AK8Q96MA6 479 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SCLT1Q96NL6 688 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CASD1Q96PB1 797 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DACT1Q9NYF0 836 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MRE11P49959 708 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CAPSQ13938 189 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF149Q8NC42 400 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TCF25Q9BQ70 676 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SPG21Q9NZD8 308 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 F13A1P00488 732 aa22.19■■□□□ 1.14
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