RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 ATP1A2P50993 1020 aa24.44■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.44■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.44■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 CARD9Q9H257 536 aa24.44■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.44■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 CCT5P48643 541 aa24.43■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 NAA35Q5VZE5 725 aa24.43■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC45Q96CN5 670 aa24.43■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 KAT5Q92993 513 aa24.43■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.43■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 A6NNZ2 444 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 PTENP60484 403 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 C4orf19Q8IY42 314 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.41■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.41■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 CORO7P57737 925 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 CXCL9Q07325 125 aa24.4■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 TIPINQ9BVW5 301 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.4■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 PMM2O15305 246 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 TCEAL1Q15170 157 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.4■■□□□ 1.5
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RCCD1-208ENST00000557266 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 DPH5Q9H2P9 285 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 USP20Q9Y2K6 914 aa24.4■■□□□ 1.5
RCCD1-208ENST00000557266 SGPL1O95470 568 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 VCAM1P19320 739 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ADSSP30520 456 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 COPB2P35606 906 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PSMC5P62195 406 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF844Q08AG5 666 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.491e-10■■■■■ 70.9
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