RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC11A1	P49279	550 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	KRT76	Q01546	638 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	GOLIM4	O00461	696 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	AKAP3	O75969	853 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	C6	P13671	934 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	FCAR	P24071	287 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TFAP4	Q01664	338 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	NCAN	O14594	1321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617		M0QZ92	97 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	OPLAH	O14841	1288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXA2	O43364	376 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TGM5	O43548	720 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ECI2	O75521	394 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	SOX9	P48436	509 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	AK2	P54819	239 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CENPE	Q02224	2701 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	INSRR	P14616	1297 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CR2	P20023	1033 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ADH1A	P07327	375 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TGFB3	P10600	412 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CD59	P13987	128 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ENG	P17813	658 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PGM5	Q15124	567 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GTL3	188 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ZMYND10	O75800	440 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ADSS	P30520	456 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	ELF2	Q15723	593 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPRD	P23468	1912 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	MYF5	P13349	255 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	IL12RB1	P42701	662 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	OSMR	Q99650	979 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ABCD4-222	ENST00000555617	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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