RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530935.1

TMX4-204, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene TMX4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-204ENST00000530935 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 Q9UFV3 132 aa4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 FBXO10Q9UK96 956 aa4.78□□□□□ -1.64
TMX4-204ENST00000530935 H0Y858 1186 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 B3GALT2O43825 422 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 HRGP04196 525 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CTSSP25774 331 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NEK3P51956 506 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 LLGL1Q15334 1064 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 IL31Q6EBC2 164 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 KAT5Q92993 513 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 HDAC10Q969S8 669 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PSMD1Q99460 953 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 USP25Q9UHP3 1055 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM50BQ9Y247 325 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PMM2O15305 246 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CYP7B1O75881 506 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 KLHL18O94889 574 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 GAAP10253 952 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 ZNF28P17035 718 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 STAT5BP51692 787 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NOMO1Q15155 1222 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MLANAQ16655 118 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MAN2A1Q16706 1144 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MORC4Q8TE76 937 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 WDR92Q96MX6 357 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CGRRF1Q99675 332 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 RPTORQ8N122 1335 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM227AF5H4B4 570 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FSBPO95073 299 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SLC5A1P13866 664 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 HTR1BP28222 390 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 POLD1P28340 1107 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 IL13P35225 146 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 ETV4P43268 484 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SLC6A9P48067 706 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 KCNQ1P51787 676 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MAP2K6P52564 334 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 DLG4P78352 724 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MESP2Q0VG99 397 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PICALMQ13492 652 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 BRD3Q15059 726 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 UBE3CQ15386 1083 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NPNTQ6UXI9 565 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 Q6ZVL8 140 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FAM129CQ86XR2 697 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 CERS3Q8IU89 383 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SNX33Q8WV41 574 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 NUDT11Q96G61 164 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 L1RE1Q9UN81 338 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-204ENST00000530935 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms