RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 SPECC1Q5M775 1068 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 HLA-CQ95604 372 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 IPPQ9Y573 584 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-211ENST00000529899 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 LINC01565O15544 149 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 HIP1RO75146 1068 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NPTXRO95502 500 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 LAG3P18627 525 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PDCP20941 246 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 RAB27AP51159 221 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ERVFC1P60507 584 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 POU5F1BQ06416 359 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 USP49Q70CQ1 688 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CABP7Q86V35 215 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 GBP3Q9H0R5 595 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 DNM3Q9UQ16 869 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 STX6O43752 255 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 KCNA5P22460 613 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 HYIQ5T013 277 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NOTUMQ6P988 496 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 HSCBQ8IWL3 235 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF558Q96NG5 402 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 USP28Q96RU2 1077 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CSRNP2Q9H175 543 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 IGFLR1Q9H665 355 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 SFI1A8K8P3 1242 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 POMCP01189 267 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NAMPTP43490 491 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 BCAR1P56945 870 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 DEPTORQ8TB45 409 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ZFP42Q96MM3 310 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 FZD8Q9H461 694 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 RSAD1Q9HA92 442 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 AAASQ9NRG9 546 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 DDHD2O94830 711 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PRKCBP05771 671 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 SKIP12755 728 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 BMP1P13497 986 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 AKAP5P24588 427 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 MLH1P40692 756 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 SLC12A3P55017 1021 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PEX3P56589 373 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CLIC6Q96NY7 704 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 GAD1Q99259 594 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 MIOSQ9NXC5 875 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CLDND1Q9NY35 253 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 KLK14Q9P0G3 267 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 COG5Q9UP83 839 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 STK24Q9Y6E0 443 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PER2O15055 1255 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 TBX10O75333 385 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 PLA2G4BP0C869 781 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 ITGA4P13612 1032 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 AXLP30530 894 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-211ENST00000529899 LTBRP36941 435 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms