RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA7O14818 248 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0355O15063 1070 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNA1Q09470 495 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 CENPPQ6IPU0 288 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 ZPBP2Q6X784 338 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 CAVIN2O95810 425 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKCBP05771 671 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 SIP14410 1827 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 GBP3Q9H0R5 595 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 PDXKO00764 312 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 MBTPS1Q14703 1052 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS6KA5O75582 802 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ERLIN2O94905 339 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 AXLP30530 894 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 LPIN1Q14693 890 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM228AQ86W67 206 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR182O15218 404 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TGFB1I1O43294 461 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPAN1O60635 241 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 EDN1P05305 212 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CCNE1P24864 410 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC63Q05C16 580 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PAK1Q13153 545 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RX5Q93086 422 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TIMP1P01033 207 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1B0GUA9 196 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 BICDL2A1A5D9 508 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TOM1L1O75674 476 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 GHRP10912 638 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 GPNMBQ14956 572 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NFIL3Q16649 462 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NELFBQ8WX92 580 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CHST12Q9NRB3 414 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PADI3Q9ULW8 664 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 B4GALT5O43286 388 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PROZP22891 400 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2C18P33260 490 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 RFC2P35250 354 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 LIG4P49917 911 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TTI2Q6NXR4 508 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 BICD1Q96G01 975 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.11■■□□□ 1.45
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