RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 PDHXO00330 501 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SSR1P43307 286 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SLC18A3Q16572 532 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ABHD15Q6UXT9 468 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NIPA1Q7RTP0 329 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TAF4BQ92750 862 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 C12orf42Q96LP6 360 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MAP7D2Q96T17 732 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CEP104O60308 925 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ATP4AP20648 1035 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CLCN3P51790 818 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF131P52739 623 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PALB2Q86YC2 1186 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GOLGA5Q8TBA6 731 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PLEKHO2Q8TD55 490 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TATDN2Q93075 761 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 OSGEPQ9NPF4 335 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PNMA2Q9UL42 364 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MAFGO15525 162 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 OATP04181 439 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 KRT19P08727 400 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 H2AFZP0C0S5 128 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GJA5P36382 358 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 OAZ1P54368 228 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SNAPC2Q13487 334 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 H2AFVQ71UI9 128 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 RIOX2Q8IUF8 465 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 IFT81Q8WYA0 676 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PNKPQ96T60 521 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 KCND2Q9NZV8 630 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 APEX2Q9UBZ4 518 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CPA4Q9UI42 421 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 28.8
PTPRK-216ENST00000524481 PASD1Q8IV76 773 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MCPH1Q8NEM0 835 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 KIFAP3Q92845 792 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MSTO1Q9BUK6 570 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NAGPAQ9UK23 515 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF286BP0CG31 522 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CD58P19256 250 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GJC1P36383 396 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ERVK-9P63128 1117 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 AP1M1Q9BXS5 423 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PFASO15067 1338 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SOX5P35711 763 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 NEDD9Q14511 834 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 BMT2Q1RMZ1 405 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SSC5DA1L4H1 1573 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ESYT3A0FGR9 886 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF233A6NK53 670 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SGPL1O95470 568 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 ADCYAP1R1P41586 468 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GALCP54803 685 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 GYS2P54840 703 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 VSNL1P62760 191 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 PEX26Q7Z412 305 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SEMA4DQ92854 862 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC102AQ96A19 550 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 IWS1Q96ST2 819 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 AKT3Q9Y243 479 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 JRKLQ9Y4A0 524 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRK-216ENST00000524481 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms