RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	IL2	P60568	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ADAM8	P78325	824 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	HAS1	Q92839	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	BRINP1	O60477	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	OPHN1	O60890	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ULK1	O75385	1050 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PROZ	P22891	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	GPR15	P49685	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RABGGTB	P53611	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	USP7	Q93009	1102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TTC1	Q99614	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	NEMP1	O14524	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MTSS1	O43312	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	EYA4	O95677	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	NUDT3	O95989	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	GC	P02774	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PFKM	P08237	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PTGS2	P35354	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	IL12RB1	P42701	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SESN3	P58005	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	DDB1	Q16531	1140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	KRT40	Q6A162	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MNT	Q99583	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TOX4	O94842	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CPE	P16870	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	NR4A1	P22736	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	LMO1	P25800	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753		K7ESF4	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	KDM1A	O60341	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	STC2	O76061	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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