RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 PLS3P13797 630 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM189BP81408 668 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ADGRE1Q14246 886 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 MAPK6Q16659 721 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 AMHR2Q16671 573 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A0U1RQF3 1178 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 PRKCBP05771 671 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 GATMP50440 423 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 EFNA5P52803 228 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 GIT2Q14161 759 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ADALQ6DHV7 355 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 DYMQ7RTS9 669 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 IQUBQ8NA54 791 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 FZD8Q9H461 694 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 MYMKA6NI61 221 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC16A4O15374 487 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 DGKIO75912 1065 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CMA1P23946 247 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 AXLP30530 894 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TAP1Q03518 808 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 E2F4Q16254 413 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 LONRF3Q496Y0 759 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 NOTUMQ6P988 496 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 MYCT1Q8N699 235 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 STAMQ92783 540 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CERS4Q9HA82 394 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 PARVGQ9HBI0 331 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 USP20Q9Y2K6 914 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-214ENST00000509677 TTC3P53804 2025 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A1B0GVL5 298 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 K7ERI5 159 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 FGFR1P11362 822 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 SMTNP53814 917 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM187BQ17R55 369 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 DDX12PQ92771 950 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ASB2Q96Q27 587 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 LINC01553A4QN01 128 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ACKR2O00590 384 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 SKIP12755 728 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 PFKFB1P16118 471 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF131P52739 623 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 UBXN11Q5T124 520 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 SPRED2Q7Z698 418 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC51Q96ER9 411 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 CUEDC2Q9H467 287 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 EOMESO95936 686 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 EDN1P05305 212 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB27AP51159 221 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 FIBCD1Q8N539 461 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 FSIP1Q8NA03 581 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-214ENST00000509677 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms