RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 GJB7Q6PEY0 223 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 DENND3A2RUS2 1198 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC169A6NNP5 214 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 ALDH1A1P00352 501 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CNGA1P29973 690 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX5P35711 763 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL2P36404 184 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP4BP1P59074 171 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM58Q8NG06 486 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 ENC1O14682 589 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 MTERF2Q49AM1 385 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR81Q562E7 1941 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 MROH8Q9H579 483 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 NAGPAQ9UK23 515 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 PPME1Q9Y570 386 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CTAGE8P0CG41 777 aa11.72□□□□□ -0.53
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