RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 GPR135Q8IZ08 494 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FATE1Q969F0 183 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GPHA2Q96T91 129 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 IL23AQ9NPF7 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.02□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TRIM75PA6NK02 468 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FOXS1O43638 330 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ZNF623O75123 536 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 KATNA1O75449 491 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 NPEPPSP55786 919 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 EVA1CP58658 441 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 IGBP1P78318 339 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ADAM8P78325 824 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CDK17Q00537 523 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 EFEMP1Q12805 493 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MTMR1Q13613 665 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GRM7Q14831 915 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ANO4Q32M45 955 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 KCNK18Q7Z418 384 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FUKQ8N0W3 1084 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TCF25Q9BQ70 676 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 DEF6Q9H4E7 631 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 NCDNQ9UBB6 729 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.01□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PRAMEF4O60810 478 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 COMTP21964 271 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SELENOPP49908 381 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 HHEXQ03014 270 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ICAM4Q14773 271 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 C19orf54Q5BKX5 351 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CMTM4Q8IZR5 234 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TSPEARQ8WU66 669 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ARL8AQ96BM9 186 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FAM89AQ96GI7 184 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MKS1Q9NXB0 559 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ING3Q9NXR8 418 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MRFAP1Q9Y605 127 aa6□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 RPTORQ8N122 1335 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SHTN1A0MZ66 631 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 UBE2QL1A1L167 161 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PHF2O75151 1096 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MYBL2P10244 700 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GYPEP15421 78 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MTNR1BP49286 362 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 DUSP2Q05923 314 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ACAP1Q15027 740 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 UBE3CQ15386 1083 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CLUL1Q15846 466 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 INAVAQ3KP66 663 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 Q8TCH9 128 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 C8orf49Q96NF6 230 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CD248Q9HCU0 757 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.99□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TMEM127O75204 238 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 RBP3P10745 1247 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 AGXTP21549 392 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CTSSP25774 331 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 KRT85P78386 507 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ADRM1Q16186 407 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MFSD5Q6N075 450 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 D2HGDHQ8N465 521 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 SNX33Q8WV41 574 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GREM2Q9H772 168 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 KLHL33A6NCF5 533 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GABRDO14764 452 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MT-CO1P00395 513 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GASTP01350 101 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 OSMP13725 252 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms