RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-215ENST00000486199 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ST18O60284 1047 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MSCO60682 206 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CYP17A1P05093 508 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 BMP2P12643 396 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 STAT5AP42229 794 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TUBP50607 506 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 KIF11P52732 1056 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ID3Q02535 119 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ERV3-1Q14264 604 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SURF1Q15526 300 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 PPM1NQ8N819 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MGARPQ8TDB4 240 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RUBCNQ92622 972 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 DPF3Q92784 378 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MSRAQ9UJ68 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CBLCQ9ULV8 474 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CCDC154A6NI56 674 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 STXBP3O00186 592 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SLC16A6O15403 523 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SCGB1D1O95968 90 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CPB1P15086 417 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CREMQ03060 361 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 PTK2BQ14289 1009 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 PTPN14Q15678 1187 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TIGD6Q17RP2 521 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ODF2Q5BJF6 829 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 KSR1Q8IVT5 923 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 OXR1Q8N573 874 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SNX21Q969T3 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ASIC4Q96FT7 647 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 GHITMQ9H3K2 345 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 DEF6Q9H4E7 631 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CEP72Q9P209 647 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ZNF711Q9Y462 761 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 A0A1W2PPL8 197 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 DOK2O60496 412 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 FSBPO95073 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 KCNA2P16389 499 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CD33P20138 364 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 POLD2P49005 469 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 FGL2Q14314 439 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 NKG7Q16617 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MUM1Q2TAK8 710 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 BEND5Q7L4P6 421 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 CPOQ8IVL8 374 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ANKS1AQ92625 1134 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 WDR18Q9BV38 432 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 SERHLQ9NQF3 203 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 USP19O94966 1318 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms