RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.751e-6■■■■□ 26.4
C9orf3-215ENST00000478473 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 KRT17Q04695 432 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 FAM187BQ17R55 369 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 CSRNP2Q9H175 543 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 TBX10O75333 385 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 BCAR1P56945 870 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 KCNC3Q14003 757 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 MCTP1Q6DN14 999 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 FZD8Q9H461 694 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 RSAD1Q9HA92 442 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 A0A1B0GUA9 196 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 H3BQV1 296 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 EYA4O95677 639 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 PBX3P40426 434 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC1BQ9P126 229 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 FAM50BQ9Y247 325 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 IPPQ9Y573 584 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.95■■□□□ 1.75
C9orf3-215ENST00000478473 LINC01565O15544 149 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 GALTP07902 379 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 IL9P15248 144 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 NRIP1P48552 1158 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 DUSP6Q16828 381 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 HYIQ5T013 277 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 TLE6Q9H808 572 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 GLP2RO95838 553 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 NAMPTP43490 491 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 COASYQ13057 564 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 KRT79Q5XKE5 535 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 BSNDQ8WZ55 320 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 IGFLR1Q9H665 355 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 IRAK3Q9Y616 596 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 LONRF3Q496Y0 759 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 URGCPQ8TCY9 931 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 KIFAP3Q92845 792 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 IGSF21Q96ID5 467 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 CPB2Q96IY4 423 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 TCF25Q9BQ70 676 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 PP2D1A8MPX8 630 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 B4GALT5O43286 388 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 MBTPS2O43462 519 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 B4GALT3O60512 393 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 ITGA4P13612 1032 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 PPP2R5AQ15172 486 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 BRAPQ7Z569 592 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM169Q96HH4 297 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 RNF39Q9H2S5 420 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 CD320Q9NPF0 282 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 STK39Q9UEW8 545 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 CD207Q9UJ71 328 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 DNM3Q9UQ16 869 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf3-215ENST00000478473 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms