RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 EXOC1Q9NV70 894 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SMC2O95347 1197 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PRKCBP05771 671 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 STK4Q13043 487 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 DSC3Q14574 896 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 NFKBIBQ15653 356 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 SEPT8Q92599 483 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 SMARCE1Q969G3 411 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 K7ERI5 159 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ACKR2O00590 384 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MGEA5O60502 916 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ACRP10323 421 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PSMD2Q13200 908 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 APBB2Q92870 758 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 HVCN1Q96D96 273 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TBX20Q9UMR3 447 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ERLIN2O94905 339 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 GCNT3O95395 438 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ABCD1P33897 745 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 HOXD13P35453 343 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 KCNA1Q09470 495 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ALCAMQ13740 583 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 RMND1Q9NWS8 449 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 USP20Q9Y2K6 914 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PIGRP01833 764 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 BMP6P22004 513 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TMEM240Q5SV17 173 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 GDF15Q99988 308 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 GDAQ9Y2T3 454 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 UBE4BO95155 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GUA9 196 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ABLIM1O14639 778 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 AXLP30530 894 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 STRN3Q13033 797 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MORC3Q14149 939 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.12e-24■■□□□ 12.9
ACTB-210ENST00000477812 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CHST12Q9NRB3 414 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PROZP22891 400 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 UBXN11Q5T124 520 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ZPBP2Q6X784 338 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ZNF365Q70YC5 407 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CCDC51Q96ER9 411 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 CPB2Q96IY4 423 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-210ENST00000477812 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 NOTUMQ6P988 496 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ACCSQ96QU6 501 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ADAM2Q99965 735 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 RGS18Q9NS28 235 aa21.89■■□□□ 1.09
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