RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472704.1

CASK-211, Transcript of calcium/calmodulin dependent serine protein kinase, humanhuman

TSL 5

Gene CASK, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASK-211ENST00000472704 ERBINQ96RT1 1412 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 DEPDC5O75140 1603 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 REREQ9P2R6 1566 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 PCDH8O95206 1070 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 LPLP06858 475 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 LGALS4P56470 323 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 NRG3P56975 720 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 PPARAQ07869 468 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 ODF1Q14990 250 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 STPG3Q8N7X2 389 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 GAB3Q8WWW8 586 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 KCNN1Q92952 543 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 EDARQ9UNE0 448 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 IRAK3Q9Y616 596 aa7.35□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 H0Y858 1186 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 IL33O95760 270 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 KNG1P01042 644 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 MED14OSP0DP75 135 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 SLC16A1P53985 500 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 HTRA3P83110 453 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 MLC1Q15049 377 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 MAN2A1Q16706 1144 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 GGT6Q6P531 493 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 FATE1Q969F0 183 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 DPP7Q9UHL4 492 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.34□□□□□ -1.23
CASK-211ENST00000472704 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.34□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.34□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MADDQ8WXG6 1647 aa7.34□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 A0A0G2JNJ9 132 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 PRC1O43663 620 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ATF3P18847 181 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 CD83Q01151 205 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MIER2Q8N344 545 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 NOX5Q96PH1 765 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 SGPP1Q9BX95 441 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 Q9UFV3 132 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 CROTQ9UKG9 612 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.33□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 NDUFS2O75306 463 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 OSMP13725 252 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 LIMS1P48059 325 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 RTP5Q14D33 572 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 PRR31Q5SQ13 230 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 TTC8Q8TAM2 541 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 TSPEARQ8WU66 669 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 DYDC2Q96IM9 177 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 FAM84AQ96KN4 292 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 USP18Q9UMW8 372 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 VWA7Q9Y334 891 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 E9PCH4 1651 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 TET3O43151 1660 aa7.32□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 ERC2O15083 957 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 COL6A1P12109 1028 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 HSPA6P17066 643 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 C5AR1P21730 350 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 POLD1P28340 1107 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 WASP42768 502 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 TBX4P57082 545 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 MALLQ13021 153 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.31□□□□□ -1.24
CASK-211ENST00000472704 FAM129CQ86XR2 697 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms