RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469061.1

CNTNAP3-208, Transcript of contactin associated protein like 3, human

TSL 3

Gene CNTNAP3, Length 417 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MCM7	P33993	719 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BCAR1	P56945	870 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CAPS	Q13938	189 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	KCNC3	Q14003	757 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TFDP1	Q14186	410 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TCHH	Q07283	1943 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	B4GALT3	O60512	393 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GPR37L1	O60883	481 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PTEN	P60484	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	OFD1	O75665	1012 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GLRA2	P23416	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	AXL	P30530	894 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ARL2	P36404	184 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TRAPPC10	P48553	1259 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SUSD6	Q92537	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IPP	Q9Y573	584 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	INPPL1	O15357	1258 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MED24	O75448	989 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MLH1	P40692	756 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TEC	P42680	631 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SLC11A1	P49279	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RABEP1	Q15276	862 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	AMHR2	Q16671	573 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CASP10	Q92851	521 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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