RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CSRNP2Q9H175 543 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KCND2Q9NZV8 630 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CARNS1A5YM72 827 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HIP1RO75146 1068 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PLA2G4BP0C869 781 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIN1Q05586 938 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC39A14Q15043 492 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 AMHR2Q16671 573 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM187BQ17R55 369 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 URGCPQ8TCY9 931 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LPPQ93052 612 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CWH43Q9H720 699 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 THEGQ9P2T0 379 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIP11Q15643 1979 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC169A6NNP5 214 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 GRM6O15303 877 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGB1P05556 798 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKCBP05771 671 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGA4P13612 1032 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 GUCY2CP25092 1073 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1AP35813 382 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC12A3P55017 1021 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 STK38Q15208 465 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LONRF3Q496Y0 759 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 UBXN11Q5T124 520 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF558Q96NG5 402 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FZD8Q9H461 694 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RSAD1Q9HA92 442 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 POLD4Q9HCU8 107 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 IPPQ9Y573 584 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 REV3LO60673 3130 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1B0GUA9 196 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ACKR2O00590 384 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 N4BP3O15049 544 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 B4GALT5O43286 388 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 F13A1P00488 732 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LIG1P18858 919 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCG1P19174 1290 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PEX3P56589 373 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE3AQ05086 875 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ADPGKQ9BRR6 497 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HCSTQ9UBK5 93 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 COG5Q9UP83 839 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CITO14578 2027 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TCHHQ07283 1943 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 K7ERI5 159 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 OFD1O75665 1012 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FGF18O76093 207 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NPTXRO95502 500 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NPTX2P47972 431 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SMTNP53814 917 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MAPK7Q13164 816 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BECN1Q14457 450 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPECC1Q5M775 1068 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms