RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462927.5

CYTH4-208, Transcript of cytohesin 4, human

TSL 2

Gene CYTH4, Length 3,667 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH4-208	ENST00000462927	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GLG1	Q92896	1179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MS4A14	Q96JA4	679 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	LXN	Q9BS40	222 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MYH10	P35580	1976 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	CNGA1	P29973	690 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GRB10	Q13322	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PRLR	P16471	622 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	VEGFB	P49765	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SMTN	P53814	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	FCGRT	P55899	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GHRHR	Q02643	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	EPHA7	Q15375	998 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SNCB	Q16143	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	NOX5	Q96PH1	765 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ZNF263	O14978	683 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	RPA1	P27694	616 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TM4SF4	P48230	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	JAK3	P52333	1124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	RAD54L	Q92698	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	P2RX5	Q93086	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	KRT12	Q99456	494 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TSG101	Q99816	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PSAP	P07602	524 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	GLI1	P08151	1106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	RGS2	P41220	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM107A	O95990	144 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SCP2	P22307	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SFN	P31947	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SP3	Q02447	781 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	E2F5	Q15329	346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CYTH4-208	ENST00000462927	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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