RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CD320Q9NPF0 282 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC1BQ9P126 229 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FAM50BQ9Y247 325 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GUA9 196 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FSD2A1L4K1 749 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 INPPL1O15357 1258 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TBX10O75333 385 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CSPG5O95196 566 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 EYA4O95677 639 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GALTP07902 379 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PBX3P40426 434 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 IL17AQ16552 155 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 DUSP6Q16828 381 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 LONRF3Q496Y0 759 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NOTUMQ6P988 496 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PADI6Q6TGC4 694 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 RAB34Q9BZG1 259 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FZD8Q9H461 694 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PER2O15055 1255 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MBTPS2O43462 519 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GLP2RO95838 553 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 COASYQ13057 564 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FAM187BQ17R55 369 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GJD3Q8N144 294 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TCF25Q9BQ70 676 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 RSAD1Q9HA92 442 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CD207Q9UJ71 328 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 IPPQ9Y573 584 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ARID2Q68CP9 1835 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 HIDE1A8MVS5 230 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 H3BQV1 296 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DDHD2O94830 711 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ITGA4P13612 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFV1P49821 464 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CUL4AQ13619 759 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 MCTP1Q6DN14 999 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TMC7Q7Z402 723 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 URGCPQ8TCY9 931 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 IGSF21Q96ID5 467 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 CPB2Q96IY4 423 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 RNF39Q9H2S5 420 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 B4GALT5O43286 388 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 B4GALT3O60512 393 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ALDH2P05091 517 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 NAMPTP43490 491 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZP2Q05996 745 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 KRT79Q5XKE5 535 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-210ENST00000462125 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms