RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ZNF844Q08AG5 666 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SPP2Q13103 211 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 EPC2Q52LR7 807 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ALG3Q92685 438 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 KAT5Q92993 513 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ALG6Q9Y672 507 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PTENP60484 403 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MTMR3Q13615 1198 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FAM83AQ86UY5 434 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SEC14L1Q92503 715 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMEM51Q9NW97 253 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 P4HA2O15460 535 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MXI1P50539 228 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DR1Q01658 176 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DGKZQ13574 1117 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 UGCGQ16739 394 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 EMC10Q5UCC4 262 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TTLL6Q8N841 843 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FAM107BQ9H098 131 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 BACH1O14867 736 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PPARDQ03181 441 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RAB17Q9H0T7 212 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GTF2BQ00403 316 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SLC20A2Q08357 652 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 AADACL2Q6P093 401 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SGPL1O95470 568 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GPC5P78333 572 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GLG1Q92896 1179 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 EPN3Q9H201 632 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MYH11P35749 1972 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MYO1FO00160 1098 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PSMD1Q99460 953 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FMO2Q99518 471 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 VCAM1P19320 739 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PPM1EQ8WY54 764 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 KRT35Q92764 455 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ACP6Q9NPH0 428 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.08■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CCDC169A6NNP5 214 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 LYPLA2O95372 231 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ADRB2P07550 413 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 MESDQ14696 234 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R5EQ16537 467 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ODF2Q5BJF6 829 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 XKR9Q5GH70 373 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 PFASO15067 1338 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 COL4A5P29400 1685 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 WNT10BO00744 389 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 ATP9AO75110 1047 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 RTN2O75298 545 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 MARCKSL1P49006 195 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-208ENST00000460766 PGM5Q15124 567 aa22.07■■□□□ 1.12
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