RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.64■□□□□ 0.25
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIZQ2M2Z5 673 aa16.6■□□□□ 0.25
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.6■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.6■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DEFB118Q96PH6 123 aa16.6■□□□□ 0.25
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