RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LINGO3P0C6S8 592 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PLD1Q13393 1074 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PLS1Q14651 629 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HAUS3Q68CZ6 603 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A6Q92581 669 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRN2Q92932 1015 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ALG1Q9BT22 464 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RUBCNLQ9H714 662 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BRD9Q9H8M2 597 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GGT7Q9UJ14 662 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CENPBD1B2RD01 187 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 H3BRJ5 948 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BACH1O14867 736 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PDE9AO76083 593 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC130P13994 396 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KRT9P35527 623 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ETV5P41161 510 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP12P59046 1061 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf54Q08AI8 447 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PROSER3Q2NL68 480 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL12Q53G59 568 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ANKS6Q68DC2 871 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CHPFQ8IZ52 775 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NAT14Q8WUY8 206 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ATL1Q8WXF7 558 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 UROC1Q96N76 676 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EBF2Q9HAK2 575 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NCAPD3P42695 1498 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GSNP06396 782 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM9Q13443 819 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KRT32Q14532 448 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TTC22Q5TAA0 569 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF425Q6IV72 752 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RNF135Q8IUD6 432 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 METTL6Q8TCB7 284 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 IRGQQ8WZA9 623 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FANCLQ9NW38 375 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PARP2Q9UGN5 583 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 V9GYQ6 96 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GVG6 124 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RAB19A4D1S5 217 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ASLP04424 464 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCZ1BP86790 482 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K10Q02779 954 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DPH6Q7L8W6 267 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 OR8K3Q8NH51 312 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CERKQ8TCT0 537 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 WASF1Q92558 559 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PMEPA1Q969W9 287 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MPP6Q9NZW5 540 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DNM3Q9UQ16 869 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 INSRP06213 1382 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.93□□□□□ -1.46
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