RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 VTNP04004 478 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 MYL1P05976 194 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RB1P06400 928 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 MAPK6Q16659 721 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 KYAT1Q16773 422 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 IQUBQ8NA54 791 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RNF149Q8NC42 400 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 PLVAPQ9BX97 442 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 AAASQ9NRG9 546 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 GINS2Q9Y248 185 aa9.84□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 A0A087WZ62 844 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 DTNBO60941 627 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CD52P31358 61 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ALCAMQ13740 583 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ADALQ6DHV7 355 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 NOTUMQ6P988 496 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 POTEGQ6S5H5 508 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 SV2BQ7L1I2 683 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ABI1Q8IZP0 508 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 DEPTORQ8TB45 409 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 VWCEQ96DN2 955 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 USP28Q96RU2 1077 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 YME1L1Q96TA2 773 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 OSMRQ99650 979 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CLIC4Q9Y696 253 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.83□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 C9IYK1 514 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ACKR2O00590 384 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 PLA2G4BP0C869 781 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 GAP43P17677 238 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 VAC14Q08AM6 782 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 STRN3Q13033 797 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 DSC3Q14574 896 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 IL17AQ16552 155 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM228AQ86W67 206 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 PRR7Q8TB68 274 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 RAD54LQ92698 747 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM143Q96AN5 459 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 SPATA32Q96LK8 384 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRP4Q96MN2 994 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ADAM2Q99965 735 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 PBX4Q9BYU1 374 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CSRNP2Q9H175 543 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF576Q9H609 170 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.82□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 COL4A6Q14031 1691 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 K7ERI5 159 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 N4BP3O15049 544 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 NCK2O43639 380 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 DGKIO75912 1065 aa9.81□□□□□ -0.84
PAICSP3-201ENST00000428007 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms