RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS7O60861 476 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PTENP60484 403 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 AADACL2Q6P093 401 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CNPY4Q8N129 248 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 HOOK2Q96ED9 719 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TEPSINQ96N21 525 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 GOPCQ9HD26 462 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC3O60645 756 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FSBPO95073 299 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 STAT2P52630 851 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG3Q92685 438 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB17Q9H0T7 212 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC3O43617 180 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 NFIL3Q16649 462 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 QPCTQ16769 361 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD9Q9H257 536 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3CDO00329 1044 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DMAC2Q9NW81 257 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC172P0C7W6 258 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY2CP25092 1073 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R5CQ13362 524 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TMX2Q9Y320 296 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD62A6NC57 917 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT13P13646 458 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 BFSP1Q12934 665 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CPXCR1Q8N123 301 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF5Q92565 580 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ERP44Q9BS26 406 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PLTPP55058 493 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC5A5Q92911 643 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 NACC1Q96RE7 527 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX24Q9Y343 169 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PPFIA2O75334 1257 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 MNAT1P51948 309 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF131P52739 623 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DLG4P78352 724 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R5AQ15172 486 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DUPD1Q68J44 220 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 MDM1Q8TC05 714 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 AGPAT1Q99943 283 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG6Q9Y672 507 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 TISP43B9A030 160 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 SHBGP04278 402 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CAND2O75155 1236 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ARP10275 920 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83AQ86UY5 434 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 JAMLQ86YT9 394 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.825e-14■■■■■ 132.3
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD9O00144 591 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 HIP1RO75146 1068 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2MP0CAP2 368 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCKSL1P49006 195 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF22Q14807 665 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT35Q92764 455 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 C18orf8Q96DM3 657 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.15■□□□□ 0.82
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