RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC51Q96ER9 411 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 SPG21Q9NZD8 308 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 E9PMD0 336 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALT5O43286 388 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 BCAR1P56945 870 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVFC1P60507 584 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 BRAPQ7Z569 592 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CNNM3Q8NE01 707 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CSRNP2Q9H175 543 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 RSAD1Q9HA92 442 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 POLD4Q9HCU8 107 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 DNM3Q9UQ16 869 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 LZTS1Q9Y250 596 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 IPPQ9Y573 584 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.39■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 EYA4O95677 639 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGA4P13612 1032 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT17Q04695 432 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 URGCPQ8TCY9 931 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC01565O15544 149 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 LTBRP36941 435 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NAMPTP43490 491 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NRIP1P48552 1158 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R5AQ15172 486 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNK18Q7Z418 384 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DEPTORQ8TB45 409 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GBP3Q9H0R5 595 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TLE6Q9H808 572 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 HES2Q9Y543 173 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFRSF10AO00220 468 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 FSCN2O14926 492 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KIFAP3Q92845 792 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 IFT74Q96LB3 600 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TCF25Q9BQ70 676 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 APOL6Q9BWW8 343 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF39Q9H2S5 420 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD8Q9H461 694 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC28Q96AY4 2481 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GUA9 196 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX10O75333 385 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NPTXRO95502 500 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 LIG1P18858 919 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT1P21579 422 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM15Q13444 863 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM187BQ17R55 369 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 EFHBQ8N7U6 833 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM169Q96HH4 297 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PNMA5Q96PV4 448 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PLIN2Q99541 437 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.36■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PER2O15055 1255 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALT3O60512 393 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP15O95972 392 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 POMCP01189 267 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKCBP05771 671 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GALTP07902 379 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 IL9P15248 144 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms