RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361781.6

SGMS1-202, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 3,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-202ENST00000361781 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 GRIN2DO15399 1336 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LRRD1A4D1F6 860 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 FAM187AA6NFU0 413 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 KRT19P08727 400 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 HSPA1LP34931 641 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 VAMP7P51809 220 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MAPK7Q13164 816 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PADI6Q6TGC4 694 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 KRT35Q92764 455 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ERP27Q96DN0 273 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RAB20Q9NX57 234 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 NR2E1Q9Y466 385 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PLS3P13797 630 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 HSPA6P17066 643 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 GIT2Q14161 759 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ABCB11O95342 1321 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 FSBPO95073 299 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 NFIAQ12857 509 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RPS6KA4O75676 772 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 DRP2Q13474 957 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PPP2R5DQ14738 602 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LONP2Q86WA8 852 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 HIPK4Q8NE63 616 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LXNQ9BS40 222 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PHF2O75151 1096 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 FECHP22830 423 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MARCKSL1P49006 195 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RASIP1Q5U651 963 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ACCSQ96QU6 501 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 DNM1LO00429 736 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 AGTP01019 485 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CALCAP01258 141 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LIG4P49917 911 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 STAT2P52630 851 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CASC4Q6P4E1 433 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 TTC17Q96AE7 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 HAS1Q92839 578 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CFAP69A5D8W1 941 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 TISP43B9A030 160 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 NOL4O94818 638 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 TTC16Q8NEE8 873 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MTMR9Q96QG7 549 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 KRT1P04264 644 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 PIK3CAP42336 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 CARD9Q9H257 536 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 ATRNO75882 1429 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-202ENST00000361781 EYA4O95677 639 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms