RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CHKBQ9Y259 395 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FAM187AA6NFU0 413 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 GJB6O95452 261 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PRDX5P30044 214 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 GJC1P36383 396 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CPA2P48052 419 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 IL9RQ01113 521 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CGB2Q6NT52 195 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 O00370 1275 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PIAS1O75925 651 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 A0A0G2JND7 137 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RFFLQ8WZ73 363 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 NDNQ99608 321 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RARGP13631 454 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 GNAQP50148 359 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 STRN3Q13033 797 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.126e-11■■■□□ 18.3
CMTM4-201ENST00000330687 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PHF2O75151 1096 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 OPHN1O60890 802 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ATP5DP30049 168 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 STAT3P40763 770 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MTM1Q13496 603 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 GNA14O95837 355 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ADCY8P40145 1251 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 VHLP40337 213 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PARP2Q9UGN5 583 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MCL1Q07820 350 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CROCCP2Q86T23 111 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 TTC1Q99614 292 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MXD3Q9BW11 206 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CCNFP41002 786 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 KCNQ4P56696 695 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MECOMQ03112 1051 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 ECEL1O95672 775 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PREBQ9HCU5 417 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 GCNT3O95395 438 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PLA2G4BP0C869 781 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 TAC1P20366 129 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CA4P22748 312 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MARK3P27448 753 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MTFR1Q15390 333 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CARD9Q9H257 536 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 AKAP3O75969 853 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 RASA1P20936 1047 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CHRNA3P32297 505 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 KRT17Q04695 432 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 SEC14L1Q92503 715 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 CEP63Q96MT8 703 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM4-201ENST00000330687 DCLRE1BQ9H816 532 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms